RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 FNBP1Q96RU3 617 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 MSTO1Q9BUK6 570 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 SPC25Q9HBM1 224 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 ACKR2O00590 384 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHB6O15197 1021 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 AKR1B10O60218 316 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 TOM1L1O75674 476 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF286BP0CG31 522 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 AKR1A1P14550 325 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 GCLMP48507 274 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCN3P51790 818 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 PTENP60484 403 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 ETF1P62495 437 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL7Q01449 175 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 SP3Q02447 781 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP24A1Q07973 514 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 DRP2Q13474 957 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 MTF1Q14872 753 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIK4Q16099 956 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM132AQ24JP5 1023 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM65Q6PJ69 517 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 TLK2Q86UE8 772 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 DESI2Q9BSY9 194 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 STK33Q9BYT3 514 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 GANQ9H2C0 597 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 AKT3Q9Y243 479 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 NRCAMQ92823 1304 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0B4J269 797 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF5CO60282 957 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 ZEB2O60315 1214 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 MSCO60682 206 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHA2P01877 340 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKCBP05771 671 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM49P0CI25 452 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM49CP0CI26 452 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 GNAT1P11488 350 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTN1P12814 892 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP2K2P36507 400 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 STAT1P42224 750 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 FLT3LGP49771 235 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 MXI1P50539 228 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 RAPGEF1Q13905 1077 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 SURF1Q15526 300 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS36Q86VN1 386 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF592Q92610 1267 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM81BQ96LP2 452 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 NLRP4Q96MN2 994 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 KATNAL1Q9BW62 490 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 FZD8Q9H461 694 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM8AQ9HCN3 771 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 LCTP09848 1927 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT86O43790 486 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 ADRB2P07550 413 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL3P08590 195 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 DLATP10515 647 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 TNNI1P19237 187 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 AP3M2P53677 418 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 TERF1P54274 439 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 CHMP4BP1P59074 171 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 DLG4P78352 724 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXK2Q01167 660 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP3CAQ08209 521 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL30Q0D2K2 578 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMD6Q15008 389 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF6Q15052 776 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 ASIC2Q16515 512 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM187BQ17R55 369 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 CBWD6Q4V339 395 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 CBWD3Q5JTY5 395 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 CBWD5Q5RIA9 395 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1328Q86T90 577 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL13Q8NEE6 735 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms