RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243077.7

LRP1-201, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 14,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-201ENST00000243077 ERP44Q9BS26 406 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 MYBPC2Q14324 1141 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TTLL4Q14679 1199 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 C18orf8Q96DM3 657 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 HIC2Q96JB3 615 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PARVBQ9HBI1 364 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 DYNLT1P63172 113 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 NCKAP1LP55160 1127 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RSAD1Q9HA92 442 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 VGLL3A8MV65 326 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 OLFM1Q99784 485 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 A8MXQ7 604 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RALBP11234 206 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SKOR1P84550 965 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ZNF560Q96MR9 790 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TTC26A0AVF1 554 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 POTECB2RU33 542 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TK2O00142 265 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SOX6P35712 828 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 CD302Q8IX05 232 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 LRRC43Q8N309 656 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 CORO7P57737 925 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RBP5P82980 135 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 EME1Q96AY2 570 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SLC2A3P11169 496 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ATP7AQ04656 1500 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TP53BP2Q13625 1128 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RAPGEF5Q92565 580 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 HSPH1Q92598 858 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ZBBXA8MT70 800 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RMDN3Q96TC7 470 aa9.49□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ZNF839A8K0R7 811 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 DGAT1O75907 488 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PASD1Q8IV76 773 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 VPS11Q9H270 941 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 MAGEB16A2A368 324 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PSTPIP1O43586 416 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RHOBTB3O94955 611 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 KLHL41O60662 606 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 GGA2Q9UJY4 613 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 LRRC41Q15345 812 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 LRRC53A6NM62 1247 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 THRAP10827 490 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 GARTP22102 1010 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SLC12A1Q13621 1099 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SASH1O94885 1247 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SOX13Q9UN79 622 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 MYO9BQ13459 2157 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ADCK1Q86TW2 530 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 FAM161BQ96MY7 647 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 RAD54BQ9Y620 910 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 OCM2P0CE71 109 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 FDFT1P37268 417 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 COPAP53621 1224 aa9.48□□□□□ -0.89
LRP1-201ENST00000243077 SNX17Q15036 470 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms