RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 NWD1Q149M9 1564 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 F8VZ95 297 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 CYP26A1O43174 497 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 SPAG6O75602 509 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 BMP6P22004 513 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 GNA15P30679 374 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 HIC1Q14526 733 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 KYNUQ16719 465 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 CNKSR1Q969H4 720 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ZWILCHQ9H900 591 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 CD58P19256 250 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 OR6B2Q6IFH4 312 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PPM1NQ8N819 430 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 WHRNQ9P202 907 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 MAD2L2Q9UI95 211 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 NEU2Q9Y3R4 380 aa11□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 SLC16A4O15374 487 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 FGFR2P21802 821 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 MAGEA4P43358 317 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 AP3M2P53677 418 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 MED21Q13503 144 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 KIF2BQ8N4N8 673 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 DNAAF3Q8N9W5 541 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf72Q96LT7 481 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 MAGEB18Q96M61 343 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 NBPF3Q9H094 633 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PDP2Q9P2J9 529 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TSPOAP1O95153 1857 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 DENND3A2RUS2 1198 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 F5H6K3 240 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PDHBP11177 359 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 AKR1B1P15121 316 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PTENP60484 403 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 AMPD2Q01433 879 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 KLRC3Q07444 240 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 RGS9BPQ6ZS82 235 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM139Q8IV31 216 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 NIM1KQ8IY84 436 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ENO4A6NNW6 628 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TRAPPC3O43617 180 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 CAND2O75155 1236 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ATP6V1G2O95670 118 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 KCNA3P22001 575 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PON1P27169 355 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PHEXP78562 749 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TMED1Q13445 227 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 MTMR1Q13613 665 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 CEP55Q53EZ4 464 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 MOXD1Q6UVY6 613 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ACAD11Q709F0 780 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 RASSF3Q86WH2 238 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PGM2Q96G03 612 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TRIM15Q9C019 465 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 MYBP10242 640 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 P3H1Q32P28 736 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 JADE1Q6IE81 842 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF677Q86XU0 584 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 HACE1Q8IYU2 909 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 GPD1LQ8N335 351 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PDZD8Q8NEN9 1154 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 SPATA20Q8TB22 786 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 OSBPL8Q9BZF1 889 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 GOLPH3Q9H4A6 298 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10.99□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 GOLGA8MH3BSY2 632 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PFDN6O15212 129 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 GH2P01242 217 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PYGBP11216 843 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 CYP11B2P19099 503 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ITGA8P53708 1063 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 PSMC5P62195 406 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 MTERF2Q49AM1 385 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 CENPTQ96BT3 561 aa10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
PTPRM-205ENST00000577827 SAT1P21673 171 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms