RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 TUSC3Q13454 348 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 GPR149Q86SP6 731 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 GDAQ9Y2T3 454 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 K7ERI5 159 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 EFEMP2O95967 443 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 GLUD1P00367 558 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 THP07101 528 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 PEX3P56589 373 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 USP41Q3LFD5 358 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.08■■□□□ 1.29
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PPP4C-211ENST00000567642 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP4C-211ENST00000567642 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
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PPP4C-211ENST00000567642 HASPINQ8TF76 798 aa23.08■■□□□ 1.29
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PPP4C-211ENST00000567642 HIP1RO75146 1068 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 PALB2Q86YC2 1186 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CHST7Q9NS84 486 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 DPP7Q9UHL4 492 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CITO14578 2027 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 MUC6Q6W4X9 2439 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 PTGESO14684 152 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31D3P0C874 917 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 MCM2P49736 904 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 USTQ9Y2C2 406 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 KMT2EQ8IZD2 1858 aa23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 ASGR2P07307 311 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 NPTX2P47972 431 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 MTMR3Q13615 1198 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 KCNK18Q7Z418 384 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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PPP4C-211ENST00000567642 PLIN2Q99541 437 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 KCNH6Q9H252 994 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 VWA8A3KMH1 1905 aa23.05■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CEP57Q86XR8 500 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 FBXL6Q8N531 539 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 ASIC4Q96FT7 647 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.04■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 KIF4AO95239 1232 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CREMQ03060 361 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 UBALD2Q8IYN6 164 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 DAW1Q8N136 415 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 FNIP2Q9P278 1114 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.03■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 SFI1A8K8P3 1242 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 TGM5O43548 720 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 RFPL2O75678 378 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 BRD1O95696 1058 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 RTP2Q5QGT7 225 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 GPR65Q8IYL9 337 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 PNMA5Q96PV4 448 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 TTPALQ9BTX7 342 aa23.02■■□□□ 1.28
PPP4C-211ENST00000567642 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.02■■□□□ 1.28
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