RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY2	Q08462	1091 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PLCB4	Q15147	1175 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RAPGEF5	Q92565	580 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA4D	Q92854	862 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL18	Q96ME1	805 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RMDN3	Q96TC7	470 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RAB20	Q9NX57	234 aa		19.76	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	DENND3	A2RUS2	1198 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559		H0YHG0	523 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CAND2	O75155	1236 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	IFT88	Q13099	833 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	FAM170A	A1A519	330 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ABCD1	P33897	745 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TTC27	Q6P3X3	843 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CNPY4	Q8N129	248 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SAAL1	Q96ER3	474 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PXMP2	Q9NR77	195 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		19.75	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ZBED4	O75132	1171 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CCNE2	O96020	404 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RARG	P13631	454 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	GCNT1	Q02742	428 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	P3H4	Q92791	437 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC19	Q9H756	370 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		19.74	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM150B	A6NC51	233 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MAFG	O15525	162 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ECEL1	O95672	775 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	AGT	P01019	485 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SLC29A2	Q14542	456 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	NLRX1	Q86UT6	975 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SLCO2A1	Q92959	643 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ART4	Q93070	314 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CABS1	Q96KC9	395 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ATP9A	O75110	1047 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SHBG	P04278	402 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MMP13	P45452	471 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CYP24A1	Q07973	514 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CALCOCO2	Q13137	446 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ICE2	Q659A1	982 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ANO5	Q75V66	913 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TATDN2	Q93075	761 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM11	Q96F44	468 aa		19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	19.73	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559		H0YCG3	227 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	WNT10B	O00744	389 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RARA	P10276	462 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	GART	P22102	1010 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MAN1A1	P33908	653 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RTP1	P59025	263 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF677	Q86XU0	584 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	NIM1K	Q8IY84	436 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	KAT2B	Q92831	832 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	GPRASP2	Q96D09	838 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		19.72	■□□□□ 0.75

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