RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 SBF2Q86WG5 1849 aa6.69□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 FOXL1Q12952 345 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 TERF2Q15554 542 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 GPR158Q5T848 1215 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.68□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 BPIFB4P59827 614 aa6.67□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.67□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.67□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 LRRC37A3O60309 1634 aa6.66□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 RAB11FIP3O75154 756 aa6.66□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 USP7Q93009 1102 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 FERMT2Q96AC1 680 aa6.66□□□□□ -1.34
ATXN3-218ENST00000553309 FAM89AQ96GI7 184 aa6.66□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.66□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 ANO3Q9BYT9 981 aa6.65□□□□□ -1.34
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ATXN3-218ENST00000553309 TNFRSF1AP19438 455 aa6.64□□□□□ -1.35
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ATXN3-218ENST00000553309 NUP155O75694 1391 aa6.64□□□□□ -1.35
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ATXN3-218ENST00000553309 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 UBE2QL1A1L167 161 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 NEMP1O14524 444 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 ZEB2O60315 1214 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 TOX4O94842 621 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 AMHP03971 560 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-218ENST00000553309 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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