RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.78	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440		A6NLC8	198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440		B4DLN1	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TISP43	B9A030	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440		B9A039	149 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440		H3BML4	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MEIS1	O00470	390 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	NCK2	O43639	380 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ADRB1	P08588	477 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	AKR1B1	P15121	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	NPTX2	P47972	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CASP5	P51878	434 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ARL4C	P56559	192 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CORO7	P57737	925 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PAK1	Q13153	545 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MIER2	Q8N344	545 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.77	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	WNT9A	O14904	365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	KPNA5	O15131	536 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ZBED4	O75132	1171 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CYBB	P04839	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	POLB	P06746	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CD3E	P07766	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	LCP1	P13796	627 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CNTF	P26441	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	LTBR	P36941	435 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TEC	P42680	631 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	LIFR	P42702	1097 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MAPK10	P53779	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CACNB3	P54284	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SCAND1	P57086	179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PRKG1	Q13976	671 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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