RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 CD302Q8IX05 232 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MYCT1Q8N699 235 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 STAMQ92783 540 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CPB2Q96IY4 423 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 ACAP3Q96P50 834 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 APOL6Q9BWW8 343 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 IRAK3Q9Y616 596 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-215ENST00000544584 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.15□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR23AA6NEV1 266 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 E9PMD0 336 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 K7ENM7 598 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 FSCN2O14926 492 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SPTLC2O15270 562 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 DTNBO60941 627 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 YEATS4O95619 227 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 POMCP01189 267 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SOD2P04179 222 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GALTP07902 379 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CTSAP10619 480 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MCF2P10911 925 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MLH1P40692 756 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 STAT6P42226 847 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MTHFRP42898 656 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 LIG4P49917 911 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HYAL1Q12794 435 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A14Q15043 492 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP6Q16828 381 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ZPBP2Q6X784 338 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RTL10Q7L3V2 364 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GPBP1Q86WP2 473 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 IQUBQ8NA54 791 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 RAD54LQ92698 747 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 LPPQ93052 612 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 HVCN1Q96D96 273 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GAD1Q99259 594 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF292O60281 2723 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 DMDP11532 3685 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR81Q562E7 1941 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 H7C4K7 107 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 WNT7AO00755 349 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 NRP1O14786 923 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC16A4O15374 487 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAK2O60296 914 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CUTAO60888 179 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP6R2O75170 966 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CSPG5O95196 566 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 KIF20AO95235 890 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 CLTAP09496 248 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00271P0C7V0 271 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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