RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 CACNA1GO43497 2377 aa21.31■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.31■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAD1O00515 517 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPTLC1O15269 473 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 GLRA2P23416 452 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRPHP41219 470 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHKA2P46019 1235 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGAP8P85298 464 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAPSQ13938 189 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR152Q8TDT2 470 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHDQ96IW2 340 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 POLD4Q9HCU8 107 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.3■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTENP60484 403 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 PADI6Q6TGC4 694 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 PJA1Q8NG27 643 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 LPPQ93052 612 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB34Q9BZG1 259 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLUHO75153 1309 aa21.29■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 TFDP1Q14186 410 aa21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.28■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 E9PMD0 336 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 LILRB3O75022 631 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADH1AP07327 375 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYT1P21579 422 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUTP22033 750 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC11A1P49279 550 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB27AP51159 221 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMNB2Q03252 620 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRT79Q5XKE5 535 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 CPB2Q96IY4 423 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CD27-AS1-208ENST00000538616 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.27■■□□□ 1
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CD27-AS1-208ENST00000538616 OFD1O75665 1012 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALDH2P05091 517 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP11B2P19099 503 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDCP20941 246 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 STARD6P59095 220 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 ST3GAL2Q16842 350 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNK18Q7Z418 384 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRAPQ7Z569 592 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 URGCPQ8TCY9 931 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.26■□□□□ 0.99
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CD27-AS1-208ENST00000538616 RTKNQ9BST9 563 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 GBP3Q9H0R5 595 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.26■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 INPPL1O15357 1258 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMTOR5O43504 91 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSPAN1O60635 241 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERLIN2O94905 339 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 URODP06132 367 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMP2P13473 410 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBXN11Q5T124 520 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNX21Q969T3 373 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYADMQ96S97 322 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLIN2Q99541 437 aa21.25■□□□□ 0.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.25■□□□□ 0.99
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