RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 FDXRP22570 491 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 GPR158Q5T848 1215 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 GPR149Q86SP6 731 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 SLC9A6Q92581 669 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 Q96MF0 132 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MATN4O95460 622 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF384Q8TF68 577 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 SNX33Q8WV41 574 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 FAM83GA6ND36 823 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 DRGXA6NNA5 263 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MGST3O14880 152 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 LSP1P33241 339 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP10-9P60411 292 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 PHC1P78364 1004 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 RNF7Q9UBF6 113 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRK-220ENST00000531466 ADCY6O43306 1168 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 ELANEP08246 267 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 ITGB6P18564 788 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 CTSSP25774 331 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 FOXF2Q12947 444 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 TERF2Q15554 542 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 GASTP01350 101 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 NFE2L2Q16236 605 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 Q6ZNX1 250 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF480Q8WV37 535 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 KDM1AO60341 852 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 C1QL1O75973 258 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 FLT3LGP49771 235 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 CLRN1P58418 232 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 RAP2BP61225 183 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 MED25Q71SY5 747 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 REPS2Q8NFH8 660 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 RNF31Q96EP0 1072 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM260Q9NX78 707 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 LPLP06858 475 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 PTPN7P35236 360 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 ABCG1P45844 678 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 RARRES1P49788 294 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 NHLH1Q02575 133 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 CASS4Q9NQ75 786 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 PJA2O43164 708 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 CRHR1P34998 444 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 LGALS4P56470 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 OCA2Q04671 838 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-220ENST00000531466 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.54□□□□□ -1.36
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