RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 MASP2O00187 686 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 CT83Q5H943 113 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SGCE-211ENST00000522045 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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SGCE-211ENST00000522045 PHF2O75151 1096 aa6.89□□□□□ -1.31
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SGCE-211ENST00000522045 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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SGCE-211ENST00000522045 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 USP7Q93009 1102 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ADAM2Q99965 735 aa6.89□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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SGCE-211ENST00000522045 CD38P28907 300 aa6.88□□□□□ -1.31
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SGCE-211ENST00000522045 C21orf58P58505 322 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 TP53BP2Q13625 1128 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 MST1LQ2TV78 715 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ACAP3Q96P50 834 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.88□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 PDE8AO60658 829 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 SPDEFO95238 335 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 LMO1P25800 156 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 IL12RB1P42701 662 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CHN2P52757 468 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CLRN1P58418 232 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 RESTQ13127 1097 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 PDCD1Q15116 288 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 METRNLQ641Q3 311 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 RAX2Q96IS3 184 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 RNF181Q9P0P0 153 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 INSL6Q9Y581 213 aa6.87□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 A0A087X0B3 334 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 DRGXA6NNA5 263 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ADCY6O43306 1168 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ULK1O75385 1050 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CDKL5O76039 1030 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CFIP05156 583 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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SGCE-211ENST00000522045 BPIP17213 487 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 PTPN7P35236 360 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 DHCR24Q15392 516 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 PRR16Q569H4 304 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ASB10Q8WXI3 467 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 NEU1Q99519 415 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 DPP7Q9UHL4 492 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 COX11Q9Y6N1 276 aa6.86□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ITGAMP11215 1152 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ENPP1P22413 925 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CXCR5P32302 372 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 SESN3P58005 492 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 FOXI1Q12951 378 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.85□□□□□ -1.31
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SGCE-211ENST00000522045 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 SLC9A6Q92581 669 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 IFT22Q9H7X7 185 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 AKR1B10O60218 316 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 ESRRBO95718 433 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CDK17Q00537 523 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 MPP3Q13368 585 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-211ENST00000522045 REPS2Q8NFH8 660 aa6.84□□□□□ -1.31
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