RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521017.5

CCNC-211, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 4

Gene CCNC, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-211ENST00000521017 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 FANCBQ8NB91 859 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 HASPINQ8TF76 798 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 IPPQ9Y573 584 aa11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCNC-211ENST00000521017 WDR64B1ANS9 1081 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 MSH4O15457 936 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ZNF806P0C7X5 589 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CCR3P51677 355 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 NFXL1Q6ZNB6 911 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ZNF410Q86VK4 478 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 FAM3CQ92520 227 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ZSWIM3Q96MP5 696 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ITGA4P13612 1032 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 AKAP5P24588 427 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CCNE1P24864 410 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CCR2P41597 374 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SOX9P48436 509 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 AP3B2Q13367 1082 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ANO5Q75V66 913 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 KBTBD6Q86V97 674 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 LONP2Q86WA8 852 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CPB2Q96IY4 423 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 COLEC11Q9BWP8 271 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 APOL6Q9BWW8 343 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 HIP1O00291 1037 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ARNTLO00327 626 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 IGHDP01880 384 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 RHOP08100 348 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CALM1P0DP23 149 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CALM2P0DP24 149 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CALM3P0DP25 149 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 VIPR2P41587 438 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 RAP1GAPP47736 663 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 NPEPPSP55786 919 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 VITQ6UXI7 678 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 MICU3Q86XE3 530 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 TMEM143Q96AN5 459 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 RSPRY1Q96DX4 576 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 BARHL2Q9NY43 387 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 KLK14Q9P0G3 267 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.62□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CACNA1EQ15878 2313 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CCDC69A6NI79 296 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 MAN2B1O00754 1011 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 HOXA9P31269 272 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CIITAP33076 1130 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PTGDRQ13258 359 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 LIN9Q5TKA1 542 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CEP68Q76N32 757 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CEP57Q86XR8 500 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SMC5Q8IY18 1101 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 GPR65Q8IYL9 337 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms