RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	LMO3	Q8TAP4	145 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	STK32A	Q8WU08	396 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CD101	Q93033	1021 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MKL1	Q969V6	931 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ANO3	Q9BYT9	981 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AZI2	Q9H6S1	392 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	EBF2	Q9HAK2	575 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	NOD2	Q9HC29	1040 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AAAS	Q9NRG9	546 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF358	Q9NW07	568 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GCNT4	Q9P109	453 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	USP20	Q9Y2K6	914 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP83	Q9Y592	693 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE4B	O95155	1302 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AFF2	P51816	1311 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD62	A6NC57	917 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MEIS1	O00470	390 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MEIS2	O14770	477 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TP73	O15350	636 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ST8SIA5	O15466	376 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SPINT1	O43278	529 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SNX3	O60493	162 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TCEA3	O75764	348 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	IL2RA	P01589	272 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP3A4	P08684	503 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	BMP2	P12643	396 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	BMP1	P13497	986 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CHRNB2	P17787	502 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP2B4	P23634	1241 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	NF2	P35240	595 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	COPB2	P35606	906 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC16A2	P36021	539 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SREBF1	P36956	1147 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MARCKSL1	P49006	195 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FMO5	P49326	533 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF131	P52739	623 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC8A3	P57103	927 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	NCALD	P61601	193 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP4	P98171	946 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CENPC	Q03188	943 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ADCY2	Q08462	1091 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNA1	Q09470	495 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CRYM	Q14894	314 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CRY2	Q49AN0	593 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ACCSL	Q4AC99	568 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC63	Q8NA47	563 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ERMN	Q8TAM6	284 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAF4	Q8WV16	495 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT35	Q92764	455 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	SLCO2A1	Q92959	643 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	ART4	Q93070	314 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	MIEF2	Q96C03	454 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	HOOK2	Q96ED9	719 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM20A	Q96MK3	541 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	FIZ1	Q96SL8	496 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-212	ENST00000515746	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55

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