RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 TUSC3Q13454 348 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC38Q5R3I4 469 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 POTEGQ6S5H5 508 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 FLCNQ8NFG4 579 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 CEP57Q86XR8 500 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.26■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.26■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 TGM5O43548 720 aa21.25■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 SEC24BO95487 1268 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2-220ENST00000511663 EFNA5P52803 228 aa21.25■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.25■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-220ENST00000511663 PDXDC1Q6P996 788 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.24■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 TTPALQ9BTX7 342 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.24■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.22■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.21■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.21■□□□□ 0.99
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SH3BP2-220ENST00000511663 PTGESO14684 152 aa21.2■□□□□ 0.98
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 POLD4Q9HCU8 107 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 USP20Q9Y2K6 914 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF3AQ9Y496 699 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAPPC3O43617 180 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 CFHP08603 1231 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMP2P13473 410 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 AOC1P19801 751 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-220ENST00000511663 PTGDRQ13258 359 aa21.19■□□□□ 0.98
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