RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		5.27	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	RASSF3	Q86WH2	238 aa		5.27	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		5.27	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		5.27	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		5.27	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	APPBP2	Q92624	585 aa		5.27	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		5.27	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268		A0A087X0B3	334 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CCDC78	A2IDD5	438 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	MARCH11	A6NNE9	402 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268		B5MCH6	92 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	DIRC3	C9JPN6	131 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	RBP3	P10745	1247 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	MPL	P40238	635 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ID4	P47928	161 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	PRR16	Q569H4	304 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	AHI1	Q8N157	1196 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	RAB11FIP3	O75154	756 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	OCRL	Q01968	901 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268		Q6ZVL8	140 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CMIP	Q8IY22	773 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	DRC1	Q96MC2	740 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	COQ10A	Q96MF6	247 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CFI	P05156	583 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	HKR1	P10072	659 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	GPR149	Q86SP6	731 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	DPP7	Q9UHL4	492 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		5.24	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	RPTOR	Q8N122	1335 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	GAST	P01350	101 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	BPI	P17213	487 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	MGAT1	P26572	445 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	PTPN7	P35236	360 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CDK17	Q00537	523 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	UGT8	Q16880	541 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	C11orf74	Q86VG3	221 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	UBXN4	Q92575	508 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	MFSD3	Q96ES6	412 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	RSAD1	Q9HA92	442 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	NEMP1	O14524	444 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	PRSS23	O95084	383 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ESRRB	O95718	433 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ITGAM	P11215	1152 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CXCR5	P32302	372 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CRHR1	P34998	444 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	AVPR1B	P47901	424 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	FLT3LG	P49771	235 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CLRN1	P58418	232 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	MED25	Q71SY5	747 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	STON2	Q8WXE9	905 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		5.22	□□□□□ -1.57
USP34-222	ENST00000498268	AKR1B10	O60218	316 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	CDC45	O75419	566 aa		5.21	□□□□□ -1.58

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