RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496124.1

PRDM15-216, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM15, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-216ENST00000496124 MIOSQ9NXC5 875 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 TMEM265A0A087WTH1 108 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GOLGA8IPA6NC78 632 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GOLGA8JA6NMD2 632 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GRM5P41594 1212 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ACOT2P49753 483 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ERVK-21P61565 698 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 STK4Q13043 487 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 HVCN1Q96D96 273 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CBWD1Q9BRT8 395 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CWH43Q9H720 699 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 BIN1O00499 593 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 DDHD2O94830 711 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 PIGRP01833 764 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 LINC00271P0C7V0 271 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 FOSL2P15408 326 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 LAG3P18627 525 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CA8P35219 290 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 MCL1Q07820 350 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 EHHADHQ08426 723 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GPM6BQ13491 265 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ALCAMQ13740 583 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 KANK3Q6NY19 840 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 KLHL23Q8NBE8 558 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 SCFD1Q8WVM8 642 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 PPM1EQ8WY54 764 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 SMARCE1Q969G3 411 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF558Q96NG5 402 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ACAP3Q96P50 834 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 STRA6Q9BX79 667 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.86■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 F8W810 466 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 PTGESO14684 152 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CLIC2O15247 247 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 BMPR1AP36894 532 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 OR1G1P47890 313 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 SLC11A1P49279 550 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CYP2J2P51589 502 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 BCAR1P56945 870 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ADGRE1Q14246 886 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 KCNT2Q6UVM3 1135 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 HASPINQ8TF76 798 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 SNX27Q96L92 541 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 FAM213AQ9BRX8 229 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 LMBRD1Q9NUN5 540 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.85■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 A0A0B4J269 797 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 OGTO15294 1046 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GRM6O15303 877 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 SMC2O95347 1197 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 MYL1P05976 194 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ADSSP30520 456 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 ABCD1P33897 745 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 HOXD13P35453 343 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 GRIK3Q13003 919 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 FAM84AQ96KN4 292 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 TMEM206Q9H813 350 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 AAASQ9NRG9 546 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.84■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 SZT2Q5T011 3432 aa15.83■□□□□ 0.13
PRDM15-216ENST00000496124 FGF18O76093 207 aa15.83■□□□□ 0.12
PRDM15-216ENST00000496124 ITGB1P05556 798 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms