RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 POTEGQ6S5H5 508 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 C8orf76Q96K31 380 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 B3GALT6Q96L58 329 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.588e-6■■■■■ 107
TRDMT1-211ENST00000495022 TGM5O43548 720 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 TADA2AO75478 443 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 MUTP22033 750 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 MAPK6Q16659 721 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 LILRA6Q6PI73 481 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PADI6Q6TGC4 694 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PALB2Q86YC2 1186 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.93■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 CITO14578 2027 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PROB1E7EW31 1015 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 GFRA3O60609 400 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP11B2P19099 503 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 NAMPTP43490 491 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 BSNDQ8WZ55 320 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.92■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH11P35749 1972 aa24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31D3P0C874 917 aa24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP2R5AQ15172 486 aa24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 NXPE3Q969Y0 559 aa24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXL21Q9UKT6 434 aa24.91■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 ACKR2O00590 384 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PRKCBP05771 671 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 MYBP10242 640 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF174Q15697 407 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 FLCNQ8NFG4 579 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 RABGGTAQ92696 567 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 PIDD1Q9HB75 910 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 SNTG2Q9NY99 539 aa24.9■■□□□ 1.58
TRDMT1-211ENST00000495022 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 PTGESO14684 152 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 RECQL4O94761 1208 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 THP07101 528 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 NPR3P17342 541 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 AOC1P19801 751 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAPPC10P48553 1259 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 RTP2Q5QGT7 225 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 DEPTORQ8TB45 409 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 MYADMQ96S97 322 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 TTPALQ9BTX7 342 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.89■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 RPL17P18621 184 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 NBL1P41271 181 aa24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC38Q5R3I4 469 aa24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 WNT16Q9UBV4 365 aa24.88■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 NARSO43776 548 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 ZMYND10O75800 440 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF4AO95239 1232 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 SEC24BO95487 1268 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 EFNA5P52803 228 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 NAB2Q15742 525 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 SIX5Q8N196 739 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 HASPINQ8TF76 798 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 KIFAP3Q92845 792 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 IFT74Q96LB3 600 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.87■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.86■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 PDXDC1Q6P996 788 aa24.86■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.86■■□□□ 1.57
TRDMT1-211ENST00000495022 NOTCH4Q99466 2003 aa24.86■■□□□ 1.57
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