RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 THNSL1Q8IYQ7 743 aa35.97■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 GSTCDQ8NEC7 633 aa35.97■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 FBXO22Q8NEZ5 403 aa35.97■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 MIOSQ9NXC5 875 aa35.97■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 C5orf67F2Z3F1 127 aa35.96■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 KINO60870 393 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 POMCP01189 267 aa35.96■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 OSTNP61366 133 aa35.96■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 PNOCQ13519 176 aa35.96■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 KANSL3Q9P2N6 904 aa35.96■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 STYXL1Q9Y6J8 313 aa35.96■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 A0A0B4J269 797 aa35.95■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 RFXAPO00287 272 aa35.95■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 HOXD13P35453 343 aa35.95■■■■□ 3.35
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CHKB-210ENST00000484266 PSMD2Q13200 908 aa35.95■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 ZNF507Q8TCN5 953 aa35.95■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 CXCL16Q9H2A7 254 aa35.95■■■■□ 3.35
CHKB-210ENST00000484266 TMEM206Q9H813 350 aa35.95■■■■□ 3.35
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CHKB-210ENST00000484266 SEZ6Q53EL9 994 aa35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 SYCP3Q8IZU3 236 aa35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 KIAA0895Q8NCT3 520 aa35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 SCFD1Q8WVM8 642 aa35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 PLVAPQ9BX97 442 aa35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 UBE4BO95155 1302 aa35.94■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 FAM189A1O60320 539 aa35.93■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 SLFN12LQ6IEE8 588 aa35.93■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 ZNF280BQ86YH2 543 aa35.93■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 AAASQ9NRG9 546 aa35.93■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 GDPD5Q8WTR4 605 aa35.92■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 MSTO1Q9BUK6 570 aa35.92■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 TRANK1O15050 2925 aa35.92■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa35.92■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 PTGESO14684 152 aa35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 OGTO15294 1046 aa35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 DDHD2O94830 711 aa35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 BMT2Q1RMZ1 405 aa35.91■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 H3BNC9 293 aa35.91■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP35.91■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 KCNT2Q6UVM3 1135 aa35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 MYLIPQ8WY64 445 aa35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 P2RX5Q93086 422 aa35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 DNAJB4Q9UDY4 337 aa35.91■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 TNFSF9P41273 254 aa35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 BCAR1P56945 870 aa35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 GRIK3Q13003 919 aa35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 ALKAL1Q6UXT8 129 aa35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 KLHL23Q8NBE8 558 aa35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 POMGNT1Q8WZA1 660 aa35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 SNX27Q96L92 541 aa35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 ZNF558Q96NG5 402 aa35.9■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 CLTAP09496 248 aa35.89■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 DSC1Q08554 894 aa35.89■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 GPM6BQ13491 265 aa35.89■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 ADGRE1Q14246 886 aa35.89■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 KYAT1Q16773 422 aa35.89■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 XKR4Q5GH76 650 aa35.89■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 NELFCDQ8IXH7 590 aa35.89■■■■□ 3.34
CHKB-210ENST00000484266 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
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CHKB-210ENST00000484266 COLGALT2Q8IYK4 626 aa35.88■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 SPATA20Q8TB22 786 aa35.88■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa35.88■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 GARTP22102 1010 aa35.87■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 SLC10A6Q3KNW5 377 aa35.87■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 TGFB1I1O43294 461 aa35.86■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 SMC2O95347 1197 aa35.86■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 ITGB1P05556 798 aa35.86■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 GALTP07902 379 aa35.86■■■■□ 3.33
CHKB-210ENST00000484266 CXCL8P10145 99 aa35.86■■■■□ 3.33
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