RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 OR1G1P47890 313 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 HYAL1Q12794 435 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 AAK1Q2M2I8 961 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TMC7Q7Z402 723 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 IQUBQ8NA54 791 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 FIZ1Q96SL8 496 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TBX20Q9UMR3 447 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ABLIM1O14639 778 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 NRP1O14786 923 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 FSCN2O14926 492 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 IDEP14735 1019 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 GAP43P17677 238 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 LIG4P49917 911 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 CLDND1Q9NY35 253 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PTGESO14684 152 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 NCK2O43639 380 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 NRIP1P48552 1158 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 OSTNP61366 133 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 NUCB2P80303 420 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 STAMQ92783 540 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 IGFLR1Q9H665 355 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ANK1P16157 1881 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 CLDN3O15551 220 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 THP07101 528 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 KCNA5P22460 613 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 CA8P35219 290 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 GTF2BQ00403 316 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 COL19A1Q14993 1142 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 VPS52Q8N1B4 723 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ASB2Q96Q27 587 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 TLE6Q9H808 572 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 MARCH5Q9NX47 278 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 STK39Q9UEW8 545 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-208ENST00000481121 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 PIGRP01833 764 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 AMPD3Q01432 767 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 TUSC3Q13454 348 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ZBP1Q9H171 429 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.76■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 FSD2A1L4K1 749 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 MCL1Q07820 350 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 HVCN1Q96D96 273 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ACAP3Q96P50 834 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 PANK4Q9NVE7 773 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.75■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 HIDE1A8MVS5 230 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ADALQ6DHV7 355 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 SNX27Q96L92 541 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 TRIM9Q9C026 710 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.74■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 PER2O15055 1255 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 LINC01565O15544 149 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 GCNT3O95395 438 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CTSAP10619 480 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 KCNQ1P51787 676 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 DUSP6Q16828 381 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 EFHBQ8N7U6 833 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-208ENST00000481121 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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