RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	STAT5A	P42229	794 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FMO1	Q01740	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	IL10RA	Q13651	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	KAT5	Q92993	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM170A	A1A519	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	OPHN1	O60890	802 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	KIT	P10721	976 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TYR	P14679	529 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FAH	P16930	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CAPN3	P20807	821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	AOAH	P28039	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP4F8	P98187	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	POSTN	Q15063	836 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ESX1	Q8N693	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TTC14	Q96N46	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	MYO1F	O00160	1098 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	CUTA	O60888	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	SOAT2	O75908	522 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	FGFR2	P21802	821 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	PTGS1	P23219	599 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ECHS1	P30084	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ARL4A	P40617	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KDM4C-208	ENST00000480996	ITGA8	P53708	1063 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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