RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472704.1

CASK-211, Transcript of calcium/calmodulin dependent serine protein kinase, humanhuman

TSL 5

Gene CASK, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASK-211ENST00000472704 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 NRG4Q8WWG1 115 aa7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 MVB12AQ96EY5 273 aa7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 LRGUKQ96M69 825 aa7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 TAAR9Q96RI9 348 aa7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 UIMC1Q96RL1 719 aa7.22□□□□□ -1.25
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CASK-211ENST00000472704 DNM3Q9UQ16 869 aa7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 IPPQ9Y573 584 aa7.22□□□□□ -1.25
CASK-211ENST00000472704 PIK3C2BO00750 1634 aa7.22□□□□□ -1.25
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CASK-211ENST00000472704 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.21□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 CARFQ8N187 725 aa7.21□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 TRPM2O94759 1503 aa7.21□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.2□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 GASTP01350 101 aa7.2□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.2□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 TTC17Q96AE7 1141 aa7.2□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.2□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 INTUQ9ULD6 942 aa7.2□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.19□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 C1QTNF9P0C862 333 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 EDNRBP24530 442 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 ECHS1P30084 290 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 CSF2RBP32927 897 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 MRE11P49959 708 aa7.19□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 KCNA10Q16322 511 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 MST1LQ2TV78 715 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 GAGE13Q4V321 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 AGBL4Q5VU57 503 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 ZNF480Q8WV37 535 aa7.19□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.19□□□□□ -1.26
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CASK-211ENST00000472704 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 SPATA25Q9BR10 227 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 MSL2Q9HCI7 577 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 RNF114Q9Y508 228 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 TNRQ92752 1358 aa7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.18□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.18□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 NRP1O14786 923 aa7.18□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 FFAR3O14843 346 aa7.18□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 RAP1GAPP47736 663 aa7.18□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 NOMO1Q15155 1222 aa7.18□□□□□ -1.26
CASK-211ENST00000472704 UBE3CQ15386 1083 aa7.18□□□□□ -1.26
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