RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, human

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSB-208	ENST00000468600	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	ITGAM	P11215	1152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	SCNN1B	P51168	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	FOXF2	Q12947	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	ADAM2	Q99965	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	SPDEF	O95238	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	GAST	P01350	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	RBP3	P10745	1247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	NHLH1	Q02575	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	MGAT5	Q09328	741 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	UBXN4	Q92575	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	APPBP2	Q92624	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	POGK	Q9P215	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	IKBKB	O14920	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	CDKL5	O76039	1030 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	FDXR	P22570	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	MPL	P40238	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	ABCG1	P45844	678 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	APBA1	Q02410	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	REST	Q13127	1097 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSB-208	ENST00000468600	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	TMEM127	O75204	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	PPARA	Q07869	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	MAPK7	Q13164	816 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	PIF1	Q9H611	641 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	MAST3	O60307	1309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	FKBP9	O95302	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	MATN4	O95460	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	ONECUT2	O95948	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	BROX	Q5VW32	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	FEZ1	Q99689	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	KDM1A	O60341	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	ITGA10	O75578	1167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	CTSS	P25774	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	CRHR1	P34998	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	ZNF81	P51508	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSB-208	ENST00000468600	IL2	P60568	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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