RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	OR14A2	Q96R54	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	PRSS50	Q9UI38	385 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	NAIP	Q13075	1403 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	KIF1A	Q12756	1690 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	FSBP	O95073	299 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	GPR15	P49685	360 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	SCAND1	P57086	179 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	CD69	Q07108	199 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	FAP	Q12884	760 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	DUSP8	Q13202	625 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	UGT8	Q16880	541 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	SPATS1	Q496A3	300 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	FUK	Q8N0W3	1084 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	CHST13	Q8NET6	341 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	RABGGTA	Q92696	567 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	C8orf49	Q96NF6	230 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	ACAP3	Q96P50	834 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	CD248	Q9HCU0	757 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM17-208	ENST00000467080	NUP155	O75694	1391 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF623	O75123	536 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	RAD17	O75943	681 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	TOX4	O94842	621 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	GAA	P10253	952 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ENPP1	P22413	925 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	LGALS4	P56470	323 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	AMPD3	Q01432	767 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	RIN1	Q13671	783 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080		Q8TCH9	128 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	UIMC1	Q96RL1	719 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	GPHA2	Q96T91	129 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	EDAR	Q9UNE0	448 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	UTRN	P46939	3433 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	DISP2	A7MBM2	1401 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CHD4	Q14839	1912 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	MYOM1	P52179	1685 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	NRP2	O60462	931 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	LY86	O95711	162 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	KIR2DL3	P43628	341 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ADAM8	P78325	824 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	MGAT5	Q09328	741 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	NELFA	Q9H3P2	528 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	DEF6	Q9H4E7	631 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	MSL2	Q9HCI7	577 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CASZ1	Q86V15	1759 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	HFM1	A2PYH4	1435 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ALS2	Q96Q42	1657 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	NRG3	P56975	720 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	KRT40	Q6A162	431 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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