RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463292.5

DMKN-223, Transcript of dermokine, human

TSL 1 (best)

Gene DMKN, Length 642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-223	ENST00000463292	CCR3	P51677	355 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	ANO5	Q75V66	913 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	RDM1	Q8NG50	284 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DMKN-223	ENST00000463292	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	ADAM12	O43184	909 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	EDIL3	O43854	480 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	PSMD10	O75832	226 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	ERLIN2	O94905	339 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CDC27	P30260	824 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CXCL12	P48061	93 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	NPEPPS	P55786	919 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	SATB1	Q01826	763 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	GRM2	Q14416	872 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	PSMD5	Q16401	504 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	NOTUM	Q6P988	496 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	DNASE1L2	Q92874	299 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	IER2	Q9BTL4	223 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	BRD9	Q9H8M2	597 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	TSPAN1	O60635	241 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	C1QTNF9	P0C862	333 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	AKAP5	P24588	427 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	GNA11	P29992	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	PSMC5	P62195	406 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CEP68	Q76N32	757 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	FAM3C	Q92520	227 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CSRNP2	Q9H175	543 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	GDE1	Q9NZC3	331 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	KLK14	Q9P0G3	267 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	WDR81	Q562E7	1941 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	TM4SF5	O14894	197 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	RHO	P08100	348 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	POU2F2	P09086	479 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CEBPB	P17676	345 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	AXL	P30530	894 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CNR2	P34972	360 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	OR1D2	P34982	312 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	USP11	P51784	963 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	LIMK1	P53667	647 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	GRIK3	Q13003	919 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	CCDC6	Q16204	474 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10	□□□□□ -0.81
DMKN-223	ENST00000463292	POTEH	Q6S545	545 aa		10	□□□□□ -0.81

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