RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 ZPBP2Q6X784 338 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ABI1Q8IZP0 508 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 GPT2Q8TD30 523 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 MYLIPQ8WY64 445 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNN1Q92952 543 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 SAAL1Q96ER3 474 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ACCSQ96QU6 501 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ADPGKQ9BRR6 497 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CBWD1Q9BRT8 395 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 PCIF1Q9H4Z3 704 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 MTMR10Q9NXD2 777 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa12.05□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0B4J269 797 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 H0YCG3 227 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CLDN3O15551 220 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 TGFB1I1O43294 461 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 LPXNO60711 386 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CXCL8P10145 99 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 MCF2P10911 925 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 SKIP12755 728 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAJB1P25685 340 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CTNNB1P35222 781 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ACOT2P49753 483 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 WNT7BP56706 349 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 MCL1Q07820 350 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF507Q8TCN5 953 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 PGBD4Q96DM1 585 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 PAAF1Q9BRP4 392 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 EXOC1Q9NV70 894 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNG1Q9UIX4 513 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 MYO7AQ13402 2215 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ANK1P16157 1881 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa12.04□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 BIN1O00499 593 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CLIC2O15247 247 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 GRM6O15303 877 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 KINO60870 393 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 BMPR1AP36894 532 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 GRM5P41594 1212 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC11A1P49279 550 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC10A6Q3KNW5 377 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 SCARA3Q6AZY7 606 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRC43Q8N309 656 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 KLHL23Q8NBE8 558 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 TIGD1Q96MW7 591 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 MSTO1Q9BUK6 570 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 STYXL1Q9Y6J8 313 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 CITO14578 2027 aa12.03□□□□□ -0.48
RPRD1B-202ENST00000449186 HOXA2O43364 376 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 RHOBTB3O94955 611 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 ITGB1P05556 798 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 BMP6P22004 513 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 GUCY2FP51841 1108 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 BCAR1P56945 870 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 CAMK1Q14012 370 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 NAB2Q15742 525 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNT2Q6UVM3 1135 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 ALKAL1Q6UXT8 129 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 POMGNT1Q8WZA1 660 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 HVCN1Q96D96 273 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM212AQ96EL1 285 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 SNX27Q96L92 541 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 ACAP3Q96P50 834 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 GBP4Q96PP9 640 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 GIT1Q9Y2X7 761 aa12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa12.01□□□□□ -0.49
RPRD1B-202ENST00000449186 CASTOR2A6NHX0 329 aa12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms