RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439600.2

LMO3-207, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2

Gene LMO3, Length 1,044 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-207ENST00000439600 NAMPTP43490 491 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 EFNA5P52803 228 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 BFSP2Q13515 415 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 PNOCQ13519 176 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 FAM26DQ5JW98 314 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 SERINC5Q86VE9 423 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ZNF410Q86VK4 478 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 LRRC15Q8TF66 581 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 SUSD3Q96L08 255 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 FAM129BQ96TA1 746 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.94□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 CCDC169A6NNP5 214 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 MICAL2O94851 1124 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 RHOBTB3O94955 611 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 PARNO95453 639 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 BMP1P13497 986 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 STIM1Q13586 685 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 SNX17Q15036 470 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 GJD3Q8N144 294 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 LINC01465Q8N7H1 131 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 DEPTORQ8TB45 409 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 CAGE1Q8TC20 777 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 TMEM143Q96AN5 459 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ZFP42Q96MM3 310 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 NFKBIZQ9BYH8 718 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 DACH1Q9UI36 760 aa11.93□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 MSX1P28360 303 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 PEX3P56589 373 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 EHHADHQ08426 723 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 USP38Q8NB14 1042 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 MLKLQ8NB16 471 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 KCNN1Q92952 543 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 HVCN1Q96D96 273 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 SCLT1Q96NL6 688 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 TMEM206Q9H813 350 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 SQORQ9Y6N5 450 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.92□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 K7ERI5 159 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 KLRC4O43908 158 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 B4GALT4O60513 344 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 CAVIN2O95810 425 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 CD4P01730 458 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 PDGFAP04085 211 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 CCDC192P0DO97 292 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 GLRA2P23416 452 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 THPOP40225 353 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 NPTX2P47972 431 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 CLCN3P51790 818 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 STRN3Q13033 797 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 COASYQ13057 564 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 MAPK7Q13164 816 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 ATCAYQ86WG3 371 aa11.91□□□□□ -0.5
LMO3-207ENST00000439600 DAW1Q8N136 415 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms