RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZPBP2Q6X784 338 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USP49Q70CQ1 688 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POF1BQ8WVV4 589 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HLA-CQ95604 372 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 THEGQ9P2T0 379 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.94□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RCCD1A6NED2 376 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARL5CA6NH57 179 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRAK2O60296 914 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOM1L1O75674 476 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MCF2P10911 925 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GAP43P17677 238 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LIG1P18858 919 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STAT6P42226 847 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCKAP1LP55160 1127 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUCB2P80303 420 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PKP1Q13835 747 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CAMK1Q14012 370 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COL19A1Q14993 1142 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KYAT1Q16773 422 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYCT1Q8N699 235 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IQUBQ8NA54 791 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRC15Q8TF66 581 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM169Q96HH4 297 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGSF21Q96ID5 467 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GAD1Q99259 594 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 REEP2Q9BRK0 252 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TLR9Q9NR96 1032 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FSCN2O14926 492 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPR37O15354 613 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDHD2O94830 711 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POMCP01189 267 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PROZP22891 400 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AKAP5P24588 427 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNAJB1P25685 340 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRM5P41594 1212 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ME1P48163 572 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT85P78386 507 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GTF2BQ00403 316 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DSC1Q08554 894 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRIK3Q13003 919 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LONRF3Q496Y0 759 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HVCN1Q96D96 273 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ASB2Q96Q27 587 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TCHPQ9BT92 498 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TNMDQ9H2S6 317 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PARP2Q9UGN5 583 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.92□□□□□ -0.98
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms