RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423296.6

WDR48-204, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 4

Gene WDR48, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-204ENST00000423296 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 GBP3Q9H0R5 595 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 TMEM206Q9H813 350 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 COL20A1Q9P218 1284 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 PFASO15067 1338 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ARID2Q68CP9 1835 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 RLFQ13129 1914 aa7.17□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 MGAMO43451 1857 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 LRRC53A6NM62 1247 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 H0YCG3 227 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 HIP1RO75146 1068 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 TACC1O75410 805 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 INHAP05111 366 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SERPING1P05155 500 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 RSPH10BP0C881 870 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 KLK7P49862 253 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 CASP5P51878 434 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ZNF131P52739 623 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 MYBPC2Q14324 1141 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 NFIL3Q16649 462 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 XKR9Q5GH70 373 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 IQCEQ6IPM2 695 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 PDXDC1Q6P996 788 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 C4orf19Q8IY42 314 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 IL31RAQ8NI17 732 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ANKRD7Q92527 254 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 GOLGA1Q92805 767 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 DEFB118Q96PH6 123 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ACCSQ96QU6 501 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SPAG5Q96R06 1193 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 CHP1Q99653 195 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 MORF4L1Q9UBU8 362 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 A0A0G2JMZ2 1700 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SFI1A8K8P3 1242 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 EXOC3O60645 756 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 CCDC172P0C7W6 258 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 PLS3P13797 630 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ANXA13P27216 316 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 KIF11P52732 1056 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 VAV2P52735 878 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 HERVK_113P62684 666 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 DOC2BQ14184 412 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 PPP2R5AQ15172 486 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 STXBP2Q15833 593 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 CHSY3Q70JA7 882 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 ZNF720Q7Z2F6 126 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 USP37Q86T82 979 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SLC35F6Q8N357 371 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 DNERQ8NFT8 737 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 KIFAP3Q92845 792 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 HVCN1Q96D96 273 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 WDR24Q96S15 920 aa7.15□□□□□ -1.26
WDR48-204ENST00000423296 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms