RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 TP73O15350 636 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ATP9AO75110 1047 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 GH1P01241 217 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ALAS1P13196 640 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 PLS3P13797 630 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 CYP11B1P15538 503 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 CDR1P51861 262 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 SP4Q02446 784 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 CETN1Q12798 172 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 TBK1Q9UHD2 729 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 GGA2Q9UJY4 613 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 GJB6O95452 261 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 TBC1D31Q96DN5 1066 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 PGM2Q96G03 612 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 CCT8L1PA6NM43 557 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ENTPD3O75355 529 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ART4Q93070 314 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 KLHL11Q9NVR0 708 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-204ENST00000409937 PPIP5K2O43314 1243 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 ECEL1O95672 775 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 CNGA2Q16280 664 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 TKFCQ3LXA3 575 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 SGO2Q562F6 1265 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 PASD1Q8IV76 773 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 HELQQ8TDG4 1101 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 BSNDQ8WZ55 320 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 PASKQ96RG2 1323 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 CFHP08603 1231 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 KYNUQ16719 465 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 XKR9Q5GH70 373 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 POTEAQ6S8J7 498 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 TCP11Q8WWU5 503 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM206Q9H813 350 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF536O15090 1300 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 CETPP11597 493 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 PDE6CP51160 858 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 HADHBP55084 474 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 RWDD2BP57060 319 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 ADCY2Q08462 1091 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 PLCB4Q15147 1175 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 SNCBQ16143 134 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 CHURC1Q8WUH1 139 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 SHC3Q92529 594 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 KCND2Q9NZV8 630 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 QARSP47897 775 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 CALCOCO2Q13137 446 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 MTMR1Q13613 665 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 PPP2R5EQ16537 467 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 CYP4X1Q8N118 509 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 POMGNT1Q8WZA1 660 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 SGSM3Q96HU1 749 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15.07■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM120BA0PK00 339 aa15.06■□□□□ 0
CNGA3-204ENST00000409937 PODXLO00592 558 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms