RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 UBE4BO95155 1302 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 A0A0B4J269 797 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 OGTO15294 1046 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 INPPL1O15357 1258 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 RECQL4O94761 1208 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 POMCP01189 267 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 CLTAP09496 248 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 LAG3P18627 525 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 CTNNB1P35222 781 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 MLH1P40692 756 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 GRIN2CQ14957 1233 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 Q7L0L9 218 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 CEP120Q8N960 986 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 SMARCE1Q969G3 411 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 ZFP42Q96MM3 310 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 GBP3Q9H0R5 595 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 MIOSQ9NXC5 875 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 LAMA3Q16787 3333 aa14.96□□□□□ -0.01
VPREB1-202ENST00000403807 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ALDH2P05091 517 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 LINC00271P0C7V0 271 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 GARTP22102 1010 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 SCNN1GP51170 649 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF558Q96NG5 402 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 COL4A6Q14031 1691 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 TISP43B9A030 160 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 H3BNC9 293 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 THP07101 528 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ADSSP30520 456 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 HOXD13P35453 343 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 GRIK3Q13003 919 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 GPM6BQ13491 265 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 SEZ6Q53EL9 994 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 SPRED2Q7Z698 418 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 SPATA20Q8TB22 786 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 P2RX5Q93086 422 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 GBF1Q92538 1859 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 DDHD2O94830 711 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 PPM1AP35813 382 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 BCAR1P56945 870 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 XKR4Q5GH76 650 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 CD302Q8IX05 232 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 HCSTQ9UBK5 93 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.93□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 RFXAPO00287 272 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 PTGESO14684 152 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 TGFB1I1O43294 461 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 GALTP07902 379 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 TNFSF9P41273 254 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ACOT2P49753 483 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 KRT17Q04695 432 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 CAMK4Q16566 473 aa14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VPREB1-202ENST00000403807 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms