RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 SCNN1GP51170 649 aa29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 CASP5P51878 434 aa29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 OSTNP61366 133 aa29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 POSTNQ15063 836 aa29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 PTPROQ16827 1216 aa29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 GDPD5Q8WTR4 605 aa29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 HPS3Q969F9 1004 aa29.99■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 NR1I2O75469 434 aa29.98■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 UBE2HP62256 183 aa29.98■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 EHHADHQ08426 723 aa29.98■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 PSMD2Q13200 908 aa29.98■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 KLHL23Q8NBE8 558 aa29.98■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 TIGD1Q96MW7 591 aa29.98■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.98■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.98■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 KINO60870 393 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 RPN1P04843 607 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 BCAR1P56945 870 aa29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 GRIK3Q13003 919 aa29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 CEP120Q8N960 986 aa29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 MSTO1Q9BUK6 570 aa29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 PLAGL2Q9UPG8 496 aa29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 A0A0B4J269 797 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 ALDH2P05091 517 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 CLTAP09496 248 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 KCNA1Q09470 495 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 ADGRE1Q14246 886 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 GBP4Q96PP9 640 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM175Q9BSA9 504 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 SPG21Q9NZD8 308 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 STYXL1Q9Y6J8 313 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 OGTO15294 1046 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 KLRC4O43908 158 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 LPXNO60711 386 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 THP07101 528 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 KRT17Q04695 432 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 DPYDQ12882 1025 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 SLC39A4Q6P5W5 647 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF280BQ86YH2 543 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 GSTCDQ8NEC7 633 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 POMGNT1Q8WZA1 660 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 SLC39A2Q9NP94 309 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 MIOSQ9NXC5 875 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 CDH23Q9H251 3354 aa29.95■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 MYO9BQ13459 2157 aa29.95■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 UBE4BO95155 1302 aa29.95■■■□□ 2.39
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD63C9JTQ0 380 aa29.95■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 FGF18O76093 207 aa29.95■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 DDHD2O94830 711 aa29.95■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 ITGB1P05556 798 aa29.95■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 UBE3AQ05086 875 aa29.95■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF507Q8TCN5 953 aa29.95■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 HAPLN2Q9GZV7 340 aa29.95■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 CHD7Q9P2D1 2997 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 GALTP07902 379 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 PLCB3Q01970 1234 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJB4Q9UDY4 337 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 PRR29P0C7W0 189 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 PBX3P40426 434 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 DSC1Q08554 894 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 COLGALT2Q8IYK4 626 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 SLC39A11Q8N1S5 342 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 GLIS3Q8NEA6 775 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM169Q96HH4 297 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 FAN1Q9Y2M0 1017 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 MTCH2Q9Y6C9 303 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 GRM6O15303 877 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 SEZ6Q53EL9 994 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 SPPL3Q8TCT6 385 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 SNX27Q96L92 541 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 SLC38A7Q9NVC3 462 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 LZTS1Q9Y250 596 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 TISP43B9A030 160 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 PTGESO14684 152 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 RHOBTB3O94955 611 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 KIF20AO95235 890 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 SMC2O95347 1197 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 GARTP22102 1010 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-204ENST00000400919 OR1G1P47890 313 aa29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms