RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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CNN3-202ENST00000394202 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.29■■□□□ 1.64
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CNN3-202ENST00000394202 MBTPS1Q14703 1052 aa25.29■■□□□ 1.64
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CNN3-202ENST00000394202 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.29■■□□□ 1.64
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CNN3-202ENST00000394202 STAG3L1P0CL83 205 aa25.28■■□□□ 1.64
CNN3-202ENST00000394202 CD52P31358 61 aa25.28■■□□□ 1.64
CNN3-202ENST00000394202 PSMD6Q15008 389 aa25.28■■□□□ 1.64
CNN3-202ENST00000394202 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.28■■□□□ 1.64
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CNN3-202ENST00000394202 FAM212AQ96EL1 285 aa25.27■■□□□ 1.64
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CNN3-202ENST00000394202 CXCL8P10145 99 aa25.26■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 TLE2Q04725 743 aa25.26■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.26■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.26■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 CAND2O75155 1236 aa25.25■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 GYPCP04921 128 aa25.25■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 SLC9A1P19634 815 aa25.25■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 RBL2Q08999 1139 aa25.25■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 FAAP100Q0VG06 881 aa25.25■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.25■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.25■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 TMX1Q9H3N1 280 aa25.25■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 ACTN1P12814 892 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 SLC10A6Q3KNW5 377 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 CAGE1Q8TC20 777 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 FNBP1Q96RU3 617 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 SNTG2Q9NY99 539 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 GPR182O15218 404 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 TNNI1P19237 187 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 PON1P27169 355 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 SV2AQ7L0J3 742 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.24■■□□□ 1.63
CNN3-202ENST00000394202 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 MYL7Q01449 175 aa25.23■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.23■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.23■■□□□ 1.63
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CNN3-202ENST00000394202 LACTBL1A8MY62 500 aa25.22■■□□□ 1.63
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