RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 IL2RBP14784 551 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 CLRN1P58418 232 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 DPTQ07507 201 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 METRNLQ641Q3 311 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 MRGPREQ86SM8 312 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 SYT12Q8IV01 421 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 DRC7Q8IY82 874 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZFP28Q8NHY6 868 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 HAS1Q92839 578 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 MYEOVQ96EZ4 313 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 CEP95Q96GE4 821 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADI1Q9BV57 179 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 CSRNP2Q9H175 543 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 LANCL2Q9NS86 450 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 MOCS1Q9NZB8 636 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 HDAC5Q9UQL6 1122 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 SIK3Q9Y2K2 1263 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 AHRRA9YTQ3 701 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ITGB1P05556 798 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 HK1P19367 917 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 NR4A1P22736 598 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 BMPR1AP36894 532 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC6A9P48067 706 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ATP8B2P98198 1209 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 MTMR1Q13613 665 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 SEPT2Q15019 361 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARMC6Q6NXE6 501 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCSK4Q6UW60 755 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 Q6ZPA2 131 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 SEM1Q6ZVN7 128 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 AMOTL1Q8IY63 956 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF276Q8N554 614 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 MDM1Q8TC05 714 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-790P-201ENST00000384479 SHTN1A0MZ66 631 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 GABRDO14764 452 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 SGTAO43765 313 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADH4P08319 380 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 GUCY2FP51841 1108 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 TAP1Q03518 808 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 KLF10Q13118 480 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANKS6Q68DC2 871 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 XYLT1Q86Y38 959 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 TFAP2CQ92754 450 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 EPC1Q9H2F5 836 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 MANSC1Q9H8J5 431 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 TRHDEQ9UKU6 1024 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 SORCS3Q9UPU3 1222 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 DRGXA6NNA5 263 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 LEFTY2O00292 366 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 WNT10BO00744 389 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDHGA12O60330 932 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 OSMP13725 252 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTPN7P35236 360 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 INHBCP55103 352 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 NHLH2Q02577 135 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 MTM1Q13496 603 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 DACT2Q5SW24 774 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 AFMIDQ63HM1 303 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 SYNE4Q8N205 404 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 JADE3Q92613 823 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 PGBD4Q96DM1 585 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 DMRT3Q9NQL9 472 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMEM140Q9NV12 185 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms