RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDH7Q9ULB5 785 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCHHQ07283 1943 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTGESO14684 152 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB43O43298 467 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC37A4O43826 429 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAS7O60861 476 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ALDH2P05091 517 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 C8AP07357 584 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCR2P41597 374 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 FNTBP49356 437 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB27AP51159 221 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q6ZS52 159 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF410Q86VK4 478 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATRIPQ8WXE1 791 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 STAMQ92783 540 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 NXPE3Q969Y0 559 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 AIFM3Q96NN9 605 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
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RNU6-171P-201ENST00000384354 POLIQ9UNA4 740 aa6.06□□□□□ -1.44
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RNU6-171P-201ENST00000384354 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A087WWV3 80 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ESYT2A0FGR8 921 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM205CA6NFA0 338 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 I3L4J1 428 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 K7ESF4 209 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 TM4SF5O14894 197 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 GIPC1O14908 333 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITGA4P13612 1032 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 GJA1P17302 382 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOX9P48436 509 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGAP8P85298 464 aa6.05□□□□□ -1.44
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RNU6-171P-201ENST00000384354 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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RNU6-171P-201ENST00000384354 NTRK3Q16288 839 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSMD5Q16401 504 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 XKR3Q5GH77 459 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF149Q8NC42 400 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCEAL3Q969E4 200 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PGBD4Q96DM1 585 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTA3Q9BTC8 594 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHRDQ9H2X0 955 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPRBP23467 1997 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 M0R2N6 131 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARNTLO00327 626 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-171P-201ENST00000384354 WNT7AO00755 349 aa6.04□□□□□ -1.44
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