RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 EMC2Q15006 297 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 EFHBQ8N7U6 833 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 FBXO41Q8TF61 875 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 EPAS1Q99814 870 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 GUCY1A2P33402 732 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ADCY2Q08462 1091 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 WDR24Q96S15 920 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 PLS3P13797 630 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 CASP2P42575 452 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 PRKCEQ02156 737 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ATG16L1Q676U5 607 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ALDH1A1P00352 501 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ACCSLQ4AC99 568 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 GPRASP2Q96D09 838 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SIK2Q9H0K1 926 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 PARVAQ9NVD7 372 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 NFU1Q9UMS0 254 aa21.8■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 E9PCH4 1651 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ITGA4P13612 1032 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 VSNL1P62760 191 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC12A1Q13621 1099 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SHC4Q6S5L8 630 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 COG1Q8WTW3 980 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 PCSK1P29120 753 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 TBK1Q9UHD2 729 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 IL18RAPO95256 599 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 CAP2P40123 477 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 FGD4Q96M96 766 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.79■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 PLA2G4AP47712 749 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 NME3Q13232 169 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 PDIA6Q15084 440 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 KSR1Q8IVT5 923 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF235Q14590 738 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 GRIK1P39086 918 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SLCO1A2P46721 670 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC13A4Q9UKG4 626 aa21.78■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 RCN2Q14257 317 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 C18orf8Q96DM3 657 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 PRR29P0C7W0 189 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 ADCY1Q08828 1119 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 NLRP14Q86W24 1093 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 RFFLQ8WZ73 363 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 MROH8Q9H579 483 aa21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
NCKAP1-201ENST00000360982 TTC36A6NLP5 189 aa21.77■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.77■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.77■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 SRGAP2O75044 1071 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 SNX17Q15036 470 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 ZBTB18Q99592 522 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 EPHX2P34913 555 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 GMNCA6NCL1 334 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 SNX2O60749 519 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 RPA1P27694 616 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 RANBP1P43487 201 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 NR1H3Q13133 447 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 CNPY4Q8N129 248 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 SUN2Q9UH99 717 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 ICAM1P05362 532 aa21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NCKAP1-201ENST00000360982 SRGNP10124 158 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms