RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 GARTP22102 1010 aa29.22■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 HOXD13P35453 343 aa29.22■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ERVK-21P61565 698 aa29.22■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 AAASQ9NRG9 546 aa29.22■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 CARNS1A5YM72 827 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 RECQL4O94761 1208 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 CLTAP09496 248 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 MLH1P40692 756 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 OSTNP61366 133 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC55Q6ZSA7 311 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 CEP120Q8N960 986 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 RPS6KC1Q96S38 1066 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 SEMA6BQ9H3T3 888 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D13Q9NVG8 400 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 KLK14Q9P0G3 267 aa29.21■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF15O94989 841 aa29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 LDHAP00338 332 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ADSSP30520 456 aa29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 NELFCDQ8IXH7 590 aa29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM192Q8IY95 271 aa29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 ZFP42Q96MM3 310 aa29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 IKZF4Q9H2S9 585 aa29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 CWH43Q9H720 699 aa29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1671Q9BY89 1806 aa29.2■■■□□ 2.27
CRIP1-201ENST00000330233 TISP43B9A030 160 aa29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 RB1P06400 928 aa29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 MCM4P33991 863 aa29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 BMPR1AP36894 532 aa29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 HS2ST1Q7LGA3 356 aa29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 PLVAPQ9BX97 442 aa29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa29.2■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 POMCP01189 267 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 LAG3P18627 525 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 CAMK4Q16566 473 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ARMCX5Q6P1M9 558 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ALKAL1Q6UXT8 129 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 GSTCDQ8NEC7 633 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA5Q8TBA6 731 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 CLSTN2Q9H4D0 955 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 MIOSQ9NXC5 875 aa29.19■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 FAM189A1O60320 539 aa29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 MBD3O95983 291 aa29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 LINC00271P0C7V0 271 aa29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 EPC2Q52LR7 807 aa29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 XKR4Q5GH76 650 aa29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1468Q9P260 1216 aa29.18■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 C5orf67F2Z3F1 127 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 TGFB1I1O43294 461 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 THP07101 528 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 SCNN1GP51170 649 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 GRIK3Q13003 919 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 SEZ6Q53EL9 994 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 GPT2Q8TD30 523 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ARNTL2Q8WYA1 636 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 PDXKO00764 312 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 CTNNB1P35222 781 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 SLC10A6Q3KNW5 377 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 COBLL1Q53SF7 1204 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 CD302Q8IX05 232 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO22Q8NEZ5 403 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 P2RX5Q93086 422 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN18Q96SJ8 248 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 CBWD1Q9BRT8 395 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 NUP62CLQ9H1M0 184 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 CERS4Q9HA82 394 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 MTUS1Q9ULD2 1270 aa29.16■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 CHD9Q3L8U1 2897 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH2P05091 517 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 TNFSF9P41273 254 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ACOT2P49753 483 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 KCNT2Q6UVM3 1135 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF280BQ86YH2 543 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 C12orf56Q8IXR9 622 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 DEFB123Q8N688 67 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 SNX27Q96L92 541 aa29.15■■■□□ 2.26
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF558Q96NG5 402 aa29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms