RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 STX10O60499 249 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 AFPP02771 609 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLTAP09496 248 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLTBP09497 229 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIIPQ5JXC2 388 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAF7Q6Q0C0 670 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 DRC7Q8IY82 874 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMC2Q8TDI7 906 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNH2Q12809 1159 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM189A1O60320 539 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARNO95453 639 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 STAG3L1P0CL83 205 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFSF9P41273 254 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENPEPQ07075 957 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMD6Q15008 389 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SURF1Q15526 300 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRSK2Q8IWQ3 736 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35C1Q96A29 364 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM212AQ96EL1 285 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM49P0CI25 452 aa29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM49CP0CI26 452 aa29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLATP10515 647 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRM5P41594 1212 aa29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP120Q8N960 986 aa29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARD3BQ8TEW8 1205 aa29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACAP3Q96P50 834 aa29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX33O43247 280 aa29.78■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 HACE1Q8IYU2 909 aa29.78■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSBPL7Q9BZF2 842 aa29.78■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMRN2Q9H8L6 949 aa29.78■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC25BP30305 580 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 YARSP54577 528 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBTPS1Q14703 1052 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 INTS13Q9NVM9 706 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX21Q9UL17 535 aa29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL18RAPO95256 599 aa29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLG4P78352 724 aa29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE11AQ9HCR9 933 aa29.76■■■□□ 2.36
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNNI1P19237 187 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL23P55773 120 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CETN1Q12798 172 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBXN11Q5T124 520 aa29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 UMODL1Q5DID0 1318 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCL8P10145 99 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP2C18P33260 490 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHO2Q8TD55 490 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEPT8Q92599 483 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM2Q99965 735 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOL6Q9BWW8 343 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 FTHL17Q9BXU8 183 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM105AQ9NUU6 356 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNTG2Q9NY99 539 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF2H1P32780 548 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 FMO5P49326 533 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB27AP51159 221 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC173Q0VFZ6 552 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM192Q8IY95 271 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CGRRF1Q99675 332 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMX1Q9H3N1 280 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 IPPQ9Y573 584 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQC6 194 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBNO60934 754 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SKIP12755 728 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCLMP48507 274 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYL7Q01449 175 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMC6Q7Z403 805 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSTM4Q8IW00 320 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD302Q8IX05 232 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCLYQ96I15 445 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARP2Q9UGN5 583 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 HES2Q9Y543 173 aa29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 DSC3Q14574 896 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 APBB2Q92870 758 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERGIC2Q96RQ1 377 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT8AQ9H1J5 351 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASB7Q9H672 318 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms