RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC169A6NNP5 214 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 DNM1LO00429 736 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 PODXLO00592 558 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 SPOPO43791 374 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNJ1P48048 391 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 SEMA4DQ92854 862 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CD101Q93033 1021 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 PGM2Q96G03 612 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 NUP85Q9BW27 656 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 XKR9Q5GH70 373 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 PIM2Q9P1W9 311 aa22.53■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CCNE2O96020 404 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 GZMAP12544 262 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 SLCO1A2P46721 670 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 FMO1Q01740 532 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 GHRHRQ02643 423 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 DRP2Q13474 957 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 TNFAIP1Q13829 316 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC114Q96M63 670 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 GTF2BQ00403 316 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 PXMP2Q9NR77 195 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 RIPK3Q9Y572 518 aa22.52■■□□□ 1.2
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP2C2O75185 946 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 MTA2O94776 668 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 GGPS1O95749 300 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 RARAP10276 462 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 MMP13P45452 471 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 PSMC5P62195 406 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.199e-7■■■■□ 22.7
PTDSS2-201ENST00000308020 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 CENPTQ96BT3 561 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF653Q96CK0 615 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 SAAL1Q96ER3 474 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 CEP89Q96ST8 783 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBED4O75132 1171 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 LYPLA2O95372 231 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 SMTNP53814 917 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 PLCB4Q15147 1175 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 C4orf19Q8IY42 314 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ATG4CQ96DT6 458 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 PARP2Q9UGN5 583 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.51■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 SHC3Q92529 594 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR64B1ANS9 1081 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 VWA5AO00534 786 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP1A2P05177 515 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP11B1P15538 503 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ADSSP30520 456 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 MFAP3P55082 362 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 CYP1B1Q16678 543 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC25Q86WR0 208 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 FZD1Q9UP38 647 aa22.5■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 RIPK2O43353 540 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 GBP1P32455 592 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 MORC4Q8TE76 937 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 KLC4Q9NSK0 619 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 RASSF9O75901 435 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.49■■□□□ 1.19
PTDSS2-201ENST00000308020 POTEAQ6S8J7 498 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms