RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FNBP1Q96RU3 617 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 GCNT4Q9P109 453 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 P4HA2O15460 535 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 B4GALT4O60513 344 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CAND2O75155 1236 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 SGPL1O95470 568 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CHRNA1P02708 482 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2H1P32780 548 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFSF9P41273 254 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 GCLMP48507 274 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 MGAT3Q09327 533 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 ARID5BQ14865 1188 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CNGA4Q8IV77 575 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 MXI1P50539 228 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 NEK11Q8NG66 645 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 MFAP3LO75121 409 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CLDN10P78369 228 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM228AQ86W67 206 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP120Q8N960 986 aa22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC26A0AVF1 554 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 PMM2O15305 246 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS6KA5O75582 802 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CLTAP09496 248 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK7P50613 346 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 OSTNP61366 133 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT39Q6A163 491 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TC2NQ8N9U0 490 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQJ5 194 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TNNI1P19237 187 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 PON1P27169 355 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 SURF1Q15526 300 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM26DQ5JW98 314 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC51Q96ER9 411 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 EPHB6O15197 1021 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 NPTXRO95502 500 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 STAG3L1P0CL83 205 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC9A1P19634 815 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 WNT7BP56706 349 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CGRRF1Q99675 332 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 ANK1P16157 1881 aa22.46■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 NRDCO43847 1150 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT9P35527 623 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 LRMPQ12912 555 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM212AQ96EL1 285 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP72Q9P209 647 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.45■■□□□ 1.19
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR182O15218 404 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 IL18RAPO95256 599 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CXCL8P10145 99 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CKBP12277 381 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 GJA8P48165 433 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 SV2AQ7L0J3 742 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR49Q8IV35 697 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM192Q8IY95 271 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CAGE1Q8TC20 777 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 PANX2Q96RD6 677 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.45■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 CITO14578 2027 aa22.44■■□□□ 1.18
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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