RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270560.3

TM4SF5-201, Transcript of transmembrane 4 L six family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM4SF5, Length 708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5-201ENST00000270560 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.72■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.72■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.72■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 B4GALT3O60512 393 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 SYKP43405 635 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC11A1P49279 550 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 NDUFA8P51970 172 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 COASYQ13057 564 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 ALCAMQ13740 583 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 FSIP1Q8NA03 581 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 TMEM169Q96HH4 297 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.71■■□□□ 1.23
TM4SF5-201ENST00000270560 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 NR1I2O75469 434 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 GCNT3O95395 438 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 AFMP43652 599 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 CEP120Q8N960 986 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PAGE5Q96GU1 130 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 IGSF21Q96ID5 467 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 ACAP3Q96P50 834 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 TLR9Q9NR96 1032 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.7■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PTGESO14684 152 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 THP07101 528 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 OSTNP61366 133 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 KYAT1Q16773 422 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 UNC13DQ70J99 1090 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 ACCSQ96QU6 501 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 STK39Q9UEW8 545 aa22.69■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 NRP1O14786 923 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 MYL1P05976 194 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 CUL4BQ13620 913 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 XKR4Q5GH76 650 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.68■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 A0A0B4J269 797 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 FSCN2O14926 492 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 CSPG5O95196 566 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 CLTAP09496 248 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 MYBP10242 640 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 IRS1P35568 1242 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 OR1G1P47890 313 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 CASP5P51878 434 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 ERVFC1P60507 584 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 TUSC3Q13454 348 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 SNX27Q96L92 541 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.67■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 OGTO15294 1046 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 CASP1P29466 404 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 EHHADHQ08426 723 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 TCF25Q9BQ70 676 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 TMEM206Q9H813 350 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 EYSQ5T1H1 3165 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.66■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.65■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 NCK2O43639 380 aa22.65■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 ZNF202O95125 648 aa22.65■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 KCNE1P15382 129 aa22.65■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 KCNA1Q09470 495 aa22.65■■□□□ 1.22
TM4SF5-201ENST00000270560 POSTNQ15063 836 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms