RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MED24O75448 989 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMC5P62195 406 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ECM1Q16610 540 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC15Q8TF66 581 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 NOX5Q96PH1 765 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TET1Q8NFU7 2136 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA1P43355 309 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.155e-6■■□□□ 12.9
CAPNS1-201ENST00000246533 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0895Q8NCT3 520 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PLIN2Q99541 437 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 VGLL3A8MV65 326 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 NPEPPSP55786 919 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP221Q4G0U5 840 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT20Q8IY31 132 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SZT2Q5T011 3432 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 KLRC1P26715 233 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PTK7Q13308 1070 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB34Q9BZG1 259 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MOCS3O95396 460 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CKBP12277 381 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CSF2RAP15509 400 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MTHFD1LQ6UB35 978 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 VWCEQ96DN2 955 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP89Q96ST8 783 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TSG101Q99816 390 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 GRID2IPA4D2P6 1211 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 GNAT1P11488 350 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MTERF2Q49AM1 385 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ICE2Q659A1 982 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf74Q6P047 294 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGOQ8TEQ8 1089 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 THPOP40225 353 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM266Q2M3C6 531 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 XKR3Q5GH77 459 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 EMC10Q5UCC4 262 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 HAUS3Q68CZ6 603 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 NRBP2Q9NSY0 501 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 RRN3P2A6NIE6 340 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSHP09668 335 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PDIA5Q14554 519 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 GPNMBQ14956 572 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD5Q6N075 450 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PDXDC1Q6P996 788 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEGQ6S5H5 508 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MREGQ8N565 214 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 BAP1Q92560 729 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF15Q99988 308 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MMRN2Q9H8L6 949 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 C22orf31O95567 290 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRDL2Q6WN34 429 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PACS2Q86VP3 889 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf19Q8IY42 314 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-201ENST00000246533 YWHABP31946 246 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 MBTPS1Q14703 1052 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 RRAGAQ7L523 313 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC71Q8N4P6 559 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM167AQ96KS9 214 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC53A6NM62 1247 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCF3P0C7M6 154 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ACRP10323 421 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 PAK2Q13177 524 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 DRP2Q13474 957 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CD302Q8IX05 232 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-201ENST00000246533 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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