RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243918.9

SYS1-201, Transcript of SYS1, golgi trafficking protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYS1, Length 2,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-201ENST00000243918 CHMP2AO43633 222 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 ITIH2P19823 946 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 TAC1P20366 129 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 VPS41P49754 854 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 STRN3Q13033 797 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 ODR4Q5SWX8 454 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 NSMFQ6X4W1 530 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 VSIG1Q86XK7 387 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 MORC4Q8TE76 937 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 KAT5Q92993 513 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 TMEM237Q96Q45 408 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 MYLK2Q9H1R3 596 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 CHST7Q9NS84 486 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 EMSYQ7Z589 1322 aa13.15□□□□□ -0.3
SYS1-201ENST00000243918 WFS1O76024 890 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SGPL1O95470 568 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 FOXN2P32314 431 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 ZNF76P36508 570 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SREBF1P36956 1147 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 ITGA8P53708 1063 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SYCP3Q8IZU3 236 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 EPS8L1Q8TE68 723 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SNF8Q96H20 258 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 NINJ2Q9NZG7 142 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 ZFATQ9P243 1243 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 MTA2O94776 668 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 LINGO3P0C6S8 592 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 CCDC15Q0P6D6 951 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 ACVR2BQ13705 512 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SETDB1Q15047 1291 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SLCO2A1Q92959 643 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 ZNF653Q96CK0 615 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 GRAMD1AQ96CP6 724 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 HSD17B14Q9BPX1 270 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 A6NHS1 94 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 CDH16O75309 829 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 IVDP26440 423 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 GCLMP48507 274 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 ICA1Q05084 483 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 DYDC2Q96IM9 177 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 LRMDAQ9H2I8 198 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.14□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 RPS6KA4O75676 772 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SLITRK3O94933 977 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 CALB2P22676 271 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 RAD23BP54727 409 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 PPP3CAQ08209 521 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 CETN1Q12798 172 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 AMNQ9BXJ7 453 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 PCIF1Q9H4Z3 704 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 HAO1Q9UJM8 370 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 GGA1Q9UJY5 639 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 RASA4BC9J798 803 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 FSCN2O14926 492 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 RASA4O43374 803 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 PEX11AO75192 247 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 GZMAP12544 262 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 GM2AP17900 193 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 GNAZP19086 355 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 WDR4P57081 412 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 GTF2IP78347 998 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SARNPP82979 210 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 IL9RQ01113 521 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 DNAJC3Q13217 504 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 PARP6Q2NL67 630 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 TMEM63BQ5T3F8 832 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SLFN13Q68D06 897 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SPOCK2Q92563 424 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 C9orf72Q96LT7 481 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 ANKRD27Q96NW4 1050 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 LRRC37BQ96QE4 947 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 SEL1LQ9UBV2 794 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 LGALS13Q9UHV8 139 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 CHKBQ9Y259 395 aa13.13□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 TISP43B9A030 160 aa13.12□□□□□ -0.31
SYS1-201ENST00000243918 CYP26A1O43174 497 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms