RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 CWH43Q9H720 699 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 KLK14Q9P0G3 267 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 PARP2Q9UGN5 583 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 COL6A3P12111 3177 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 ANK1P16157 1881 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 EPOPA6NHQ4 379 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 ADSSP30520 456 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 PSMD2Q13200 908 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIN2CQ14957 1233 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB123Q8N688 67 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA20Q8TB22 786 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 UBE4BO95155 1302 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 B4GALT3O60512 393 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 OSTNP61366 133 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNB1Q14721 858 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 BMT2Q1RMZ1 405 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 EPC2Q52LR7 807 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 SEZ6Q53EL9 994 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM206Q9H813 350 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 POMCP01189 267 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 SCNN1GP51170 649 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 URGCPQ8TCY9 931 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 MIOSQ9NXC5 875 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC25A39-201ENST00000225308 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.77■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 BMPR1AP36894 532 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 SLFN12LQ6IEE8 588 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 SAMD11Q96NU1 681 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.76■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 PTGESO14684 152 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 OGTO15294 1046 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 CTNNB1P35222 781 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 ACAP3Q96P50 834 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 GSDMAQ96QA5 445 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 PBX3P40426 434 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 TNFSF9P41273 254 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 GBP3Q9H0R5 595 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.74■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 TGFB1I1O43294 461 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 DDHD2O94830 711 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 SMC2O95347 1197 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 SNX27Q96L92 541 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 GUCD1Q96NT3 240 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 CBWD1Q9BRT8 395 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 RFXAPO00287 272 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 CLTAP09496 248 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 LAG3P18627 525 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 GARTP22102 1010 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 DSC1Q08554 894 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIK3Q13003 919 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 XKR4Q5GH76 650 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 SMARCE1Q969G3 411 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 PLVAPQ9BX97 442 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 LPXNO60711 386 aa23.72■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 RB1P06400 928 aa23.72■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 CXCL8P10145 99 aa23.72■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 NAB2Q15742 525 aa23.72■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 KYAT1Q16773 422 aa23.72■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.72■■□□□ 1.39
SLC25A39-201ENST00000225308 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms