RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.61■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PALB2Q86YC2 1186 aa18.61■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TATDN2Q93075 761 aa18.61■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPRJQ12913 1337 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ZACNQ401N2 412 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PPTC7Q8NI37 304 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 MAML3Q96JK9 1138 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PSMB7Q99436 277 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TAS2R14Q9NYV8 317 aa18.6■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 SGPL1O95470 568 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 RHOXF2BP0C7M4 288 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM253P0C7T8 217 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TNNI1P19237 187 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CXCR5P32302 372 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC57Q8N9N7 239 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TPCN2Q8NHX9 752 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 AFG1LQ8WV93 481 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 RHOXF2Q9BQY4 288 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 NCANO14594 1321 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CLDN3O15551 220 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CYP26A1O43174 497 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 C22orf31O95567 290 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PRKCBP05771 671 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 MAPK4P31152 587 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 PNKPQ96T60 521 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ARID3AQ99856 593 aa18.59■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM189A1O60320 539 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 TOM1L1O75674 476 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 GJB1P08034 283 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 HARSP12081 509 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 INSRRP14616 1297 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CHRNB2P17787 502 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CLCN3P51790 818 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 HUNKP57058 714 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 MAPK6Q16659 721 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 SEZ6Q53EL9 994 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 CGRRF1Q99675 332 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 RAB21Q9UL25 225 aa18.58■□□□□ 0.57
RABGGTA-201ENST00000216840 ABLIM1O14639 778 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 HLA-DRAP01903 254 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 GCNT1Q02742 428 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 TFDP1Q14186 410 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB33Q86T24 672 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC47A2Q86VL8 602 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 METTL13Q8N6R0 699 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 TINF2Q9BSI4 451 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 DOCK3Q8IZD9 2030 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC15A5A6NIM6 579 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 VNN1O95497 513 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 SMPD1P17405 629 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 IGBP1P78318 339 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 SLFN11Q7Z7L1 901 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 NLRP4Q96MN2 994 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 PCDHB18PQ96TA0 734 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 C16orf70Q9BSU1 422 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ACP6Q9NPH0 428 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD62A6NC57 917 aa18.56■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ASAP2O43150 1006 aa18.56■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF286BP0CG31 522 aa18.56■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCB4P21439 1286 aa18.56■□□□□ 0.56
RABGGTA-201ENST00000216840 PIK3CAP42336 1068 aa18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms