RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acad12D3Z7X0 555 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp651E9PZ11 729 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BC049352E9Q2Z6 85 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TnfP06804 235 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wnt7bP28047 349 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nol4P60954 483 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plpp4Q0VBU9 271 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klhl17Q6TDP3 640 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TbataQ7TSD4 393 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 OgtQ8CGY8 1046 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm41Q8JZV4 413 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plekhh3Q8VCE9 796 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc71Q9D3W5 558 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efcab12V9GXH0 673 aa24.79■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4756A0A140LIS8 335 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zscan25B2RX31 543 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zscan29E9Q5B4 869 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PrnpP04925 254 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnj4P52189 445 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbx3P70324 741 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr15Q0VDU3 360 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 March5Q3KNM2 278 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CybbQ61093 570 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr23Q7TRX4 325 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GopcQ8BH60 463 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rsph1Q8VIG3 301 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cldnd1Q9CQX5 253 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ears2Q9CXJ1 523 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MajinQ9D992 256 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Piezo1E2JF22 2547 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm16427J3QN52 483 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TertO70372 1122 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Actn3O88990 900 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01648 108 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fgfr1P16092 822 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scarf2P59222 833 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smyd5Q3TYX3 416 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hace1Q3U0D9 909 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfml2bQ3V1G4 746 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf354cQ571J5 560 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ToporsQ80Z37 1033 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nod1Q8BHB0 953 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spata32Q8C5V0 334 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Castor2Q8CAB8 329 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ildr1Q8CBR1 537 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam151aQ8QZW3 608 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BccipQ9CWI3 316 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl2c5Q9JLV9 222 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa24.77■■□□□ 1.56
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mroh4G3X8W1 983 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r1O70410 912 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vti1aO89116 217 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp21P03940 487 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp10P52479 792 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oaz1P54369 227 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnq1P97414 668 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ostm1Q8BGT0 338 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp1Q8BJQ2 784 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chst7Q9EP78 484 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tulp1Q9Z273 543 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Umodl1Q5DID3 1319 aa24.76■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppfia4B8QI36 1187 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r111K7N674 857 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtgisO35074 501 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ndufs6P52503 116 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep120Q7TSG1 988 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp202Q8C879 641 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LgsnQ8CIX8 563 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FgbQ8K0E8 481 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem161aQ8VCA6 480 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brms1Q99N20 246 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ribc1Q9D0B8 379 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slamf8Q9D3G2 278 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Extl1Q9JKV7 669 aa24.75■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bpifb4A2BGH0 617 aa24.74■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lsp1P19973 330 aa24.74■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tekt4Q149S1 447 aa24.74■■□□□ 1.55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.4 ms