RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636481.1

CHRNA4-215, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 126 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-215ENST00000636481 MAP4K3Q8IVH8 894 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 OR2I1PQ8NGU4 316 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 RHPN1Q8TCX5 695 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 APPBP2Q92624 585 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PGBD4Q96DM1 585 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PNMA5Q96PV4 448 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PHF12Q96QT6 1004 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 MAP7D2Q96T17 732 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 CORO1BQ9BR76 489 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 KCNH3Q9ULD8 1083 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 AK5Q9Y6K8 562 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PARP14Q460N5 1801 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 NAV1Q8NEY1 1877 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 AKAP13Q12802 2813 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 FOCADQ5VW36 1801 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 HEPACAM2A8MVW5 462 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 UPK3BL1B0FP48 263 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 F8W810 466 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PLK4O00444 970 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 DPYSL4O14531 572 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 OPLAHO14841 1288 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 ZNF862O60290 1169 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 RNF40O75150 1001 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 GPR32O75388 356 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 APBB3O95704 486 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 LRG1P02750 347 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 RHOP08100 348 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SNHG28P0DPA3 235 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SKIP12755 728 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 CD59P13987 128 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 KCNA2P16389 499 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 BCKDHBP21953 392 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 TMOD1P28289 359 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 CCDC173Q0VFZ6 552 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 NFATC3Q12968 1075 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 WDR44Q5JSH3 913 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 FAM160B1Q5W0V3 765 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PMS2CLQ68D20 193 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PDXDC2PQ6P474 469 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 FUT10Q6P4F1 479 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 POTEHQ6S545 545 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 HAUS6Q7Z4H7 955 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 C11orf74Q86VG3 221 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SYT12Q8IV01 421 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 MFSD6LQ8IWD5 586 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 FAM9BQ8IZU0 186 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 LRRC71Q8N4P6 559 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 DEFB119Q8N690 84 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 NLRP7Q8WX94 980 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 BAP1Q92560 729 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 TSC1Q92574 1164 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 RABGGTAQ92696 567 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 CUL5Q93034 780 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 MSANTD3Q96H12 275 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 CDHR1Q96JP9 859 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 TTC14Q96N46 770 aa3.12□□□□□ -1.91
CHRNA4-215ENST00000636481 MBOAT7Q96N66 472 aa3.12□□□□□ -1.91
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