RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 FUKQ8N0W3 1084 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 CEP170P1Q96L14 293 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 CD58P19256 250 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 SETDB1Q15047 1291 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 RARAP10276 462 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 ATP5DP30049 168 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 TATDN2Q93075 761 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 PPP2R5AQ15172 486 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 VAV3Q9UKW4 847 aa14.77□□□□□ -0.04
HPS1-215ENST00000613394 A0A1B0GUA9 196 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 SCP2P22307 547 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ECHS1P30084 290 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ZBTB16Q05516 673 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 CLUL1Q15846 466 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 CROCCP2Q86T23 111 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 IFT74Q96LB3 600 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ECT2Q9H8V3 914 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 CYP3A7P24462 503 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 SLC8A1P32418 973 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 MTMR1Q13613 665 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 LENG9Q96B70 501 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 RASA4BC9J798 803 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 RASA4O43374 803 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 UBOX5O94941 541 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 CREB1P16220 341 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 DRD4P21917 467 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 LIN9Q5TKA1 542 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 HHATQ5VTY9 493 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 DUPD1Q68J44 220 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 NLRX1Q86UT6 975 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 CES2O00748 559 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 AGTP01019 485 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ANXA13P27216 316 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 LIG4P49917 911 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ZNF131P52739 623 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ITGA8P53708 1063 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 JAM2P57087 298 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 SESN3P58005 492 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ATP11AP98196 1134 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 TRIM7Q9C029 511 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 H0YGN5 161 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 TTC27Q6P3X3 843 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 SYNCQ9H7C4 482 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-215ENST00000613394 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms