RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612161.4

SLC38A1-211, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC38A1, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-211ENST00000612161 BRINP3Q76B58 766 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 WDR63Q8IWG1 891 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TTC39CQ8N584 583 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 APPL2Q8NEU8 664 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 WHAMMQ8TF30 809 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 FBXW5Q969U6 566 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ARL8AQ96BM9 186 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 GMCL1Q96IK5 515 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SPAG5Q96R06 1193 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PADI4Q9UM07 663 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PHF24Q9UPV7 400 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 NEO1Q92859 1461 aa6.86□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RICTORQ6R327 1708 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 FANCAO15360 1455 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SLC35F4A4IF30 521 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MAFKO60675 156 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 NDUFS2O75306 463 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CD4P01730 458 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 FESP07332 822 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 KIF5BP33176 963 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 GCKP35557 465 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 APBA1Q02410 837 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RASA2Q15283 850 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CCDC103Q8IW40 242 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PHKBQ93100 1093 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SLC35B4Q969S0 331 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ASPNQ9BXN1 380 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SYNCQ9H7C4 482 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CAPN8A6NHC0 703 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 LINC01387J3KSC0 135 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CPLX1O14810 134 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 NEMFO60524 1076 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 DLGAP3O95886 979 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MCM3P25205 808 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 KCNAB2Q13303 367 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PPP2R5BQ15173 497 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CFAP58Q5T655 872 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 EPSTI1Q96J88 318 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MAML3Q96JK9 1138 aa6.84□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms