RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602253.5

ZNF546-209, Transcript of zinc finger protein 546, human

TSL 3

Gene ZNF546, Length 396 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF546-209	ENST00000602253	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SLC30A3	Q99726	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253		C9IYK1	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253		M0QZ92	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	PRDM1	O75626	825 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	PRB1	P04280	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	GNAI2	P04899	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ITGB2	P05107	769 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	KLRC2	P26717	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ADH6	P28332	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SLC16A2	P36021	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CXCL12	P48061	93 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	TFAP4	Q01664	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SP2	Q02086	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	PAK2	Q13177	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	HTR4	Q13639	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CEP68	Q76N32	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	RGS18	Q9NS28	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CLUH	O75153	1309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	SORBS3	O60504	671 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CTSA	P10619	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	FGFR1	P11362	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	COL8A1	P27658	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	ADD2	P35612	726 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	FNTB	P49356	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	DGKG	P49619	791 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	CLCN4	P51793	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZNF546-209	ENST00000602253	TYRO3	Q06418	890 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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