RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NRCAMQ92823 1304 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 COL1A2P08123 1366 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KAT6AQ92794 2004 aa6.64□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DENND3A2RUS2 1198 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ARVCFO00192 962 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC192P0DO97 292 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GAP43P17677 238 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CLCN1P35523 988 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 THPOP40225 353 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GPC3P51654 580 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NCKAP1LP55160 1127 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TCTN1Q2MV58 587 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 IER5Q5VY09 327 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB33Q86T24 672 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ADSSL1Q8N142 457 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KIFAP3Q92845 792 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DRC1Q96MC2 740 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP7D2Q96T17 732 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ANO10Q9NW15 660 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 RMND1Q9NWS8 449 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.63□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ALPK3Q96L96 1907 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC14CA4D256 554 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEB2O15479 319 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TGFB1I1O43294 461 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 AP5Z1O43299 807 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR32O75388 356 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CABYRO75952 493 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRNA1P02708 482 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKCBP05771 671 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL1P05976 194 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GHRP10912 638 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 COL6A1P12109 1028 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NAMPTP43490 491 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF165P49910 485 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK7P50613 346 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 RTP1P59025 263 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCA2AQ02747 115 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TLE2Q04725 743 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MBTPS1Q14703 1052 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NCAPHQ15003 741 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 IQCB1Q15051 598 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 AGERQ15109 404 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TTI2Q6NXR4 508 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SERINC5Q86VE9 423 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 RETREG2Q8NC44 543 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TCP11Q8WWU5 503 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 P2RX5Q93086 422 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SAAL1Q96ER3 474 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SCLYQ96I15 445 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 IFT74Q96LB3 600 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 STRA6Q9BX79 667 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.62□□□□□ -1.35
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